夜神月設(shè)計(jì)除掉了女友和跟蹤自己的FBI的探員,趁機(jī)混進(jìn)了調(diào)查本部,但是,L對(duì)他的懷疑并沒(méi)有結(jié)束,新一輪的智力游戲繼續(xù)進(jìn)行。月和L的頭腦對(duì)峙迎來(lái)了新的局面。借著“幫助ICPO逮捕Killer”的理由,月潛入了調(diào)查本部。這樣月就和對(duì)月虎視眈眈的L直接面對(duì)面的交鋒了。但是,發(fā)生了月預(yù)想以外的事件,與死神硫克個(gè)性迥異的另一位死神雷姆也把自己的死亡筆記丟在了地球上,被一位崇拜Killer的小姑娘彌海砂撿到了。彌海砂主動(dòng)和夜神月聯(lián)系,答應(yīng)協(xié)助他除掉L,條件是讓月做自己的男朋友。彌海砂用自己一半的生命作代價(jià)取得了夜神月所沒(méi)有的特殊能力“死神之眼”,這個(gè)能力可以直接看到對(duì)方的時(shí)候就能知道對(duì)方的真名,是對(duì)付L的最強(qiáng)武器,所以月同意了和小姑娘合作。但是就在彌海砂寫下L的真名前,聰明的L先發(fā)制人,將彌海砂作為基拉嫌疑犯關(guān)進(jìn)了Killer對(duì)策室,知道同伴被監(jiān)禁后,月也提出了將自己監(jiān)禁的要求,但是一切都是在月的計(jì)算之中。夜神月為了救彌海砂,想到了一個(gè)絕妙的辦法--放棄死亡筆記所有權(quán)。同時(shí),因?yàn)橹谱魃縿?dòng)性的跟蹤報(bào)道“Killer”事件而風(fēng)頭大勁的櫻花電視臺(tái)發(fā)生了一連出人意料的事情,主播高田清美追蹤Killer的過(guò)程中發(fā)現(xiàn)了不為人知的秘密,隨即第三名Killer出現(xiàn)了。兩個(gè)死神,兩本“死亡筆記”,三個(gè)Killer,一切撲朔迷離。死亡筆記的規(guī)則被公布于眾,兩個(gè)天才的頭腦斗智也在一個(gè)一個(gè)預(yù)想之外的事件中展開(kāi)。